Publikationen und Thesen

Hier finden Sie die Veröffentlichungen des GRK 2543-Teams sowie studentische Arbeiten, die im Rahmen des GRK 2543 betreut wurden.

Journals

  1. 2023

    1. C. Veil u. a., „Enhancing Tissue Impedance Measurements Through Modeling of Fluid Flow During Viscoelastic Relaxation“, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Bd. 70, Nr. 2, Art. Nr. 2, Feb. 2023, doi: 10.1109/TBME.2022.3199468.
    2. P. Somers u. a., „Cystoscopic depth estimation using gated adversarial domain adaptation“, Biomedical Engineering Letters, Bd. 13, Nr. 2, Art. Nr. 2, Mai 2023, doi: 10.1007/s13534-023-00261-3.
    3. F. Fischer, K. Frenner, M. Granai, F. Fend, und A. Herkommer, „Data-driven development of sparse multi-spectral sensors for urological tissue differentiation“, Journal of the European Optical Society-Rapid Publications, Bd. 19, Nr. 1, Art. Nr. 1, 2023, doi: 10.1051/jeos/2023030.
    4. V. Aslani, A. Toulouse, M. Schmid, H. Giessen, T. Haist, und A. Herkommer, „3D printing of colored micro-optics“, Optical Materials Express, Bd. 13, Nr. 5, Art. Nr. 5, Apr. 2023, doi: 10.1364/ome.489681.
    5. P. L. Kalwa und T. E. Schäffer, „Water flow elastography – A promising tool to measure tissue stiffness during minimally invasive surgery“, Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials, Bd. 145, S. 106004, Sep. 2023, doi: 10.1016/j.jmbbm.2023.106004.

  2. 2022

    1. I. A. Montes-Mojarro u. a., „Multiparametric Classification of Non-Muscle Invasive Papillary Urothelial Neoplasms: Combining Morphological, Phenotypical, and Molecular Features for Improved Risk Stratification“, International Journal of Molecular Sciences, Bd. 23, Nr. 15, Art. Nr. 15, 2022, doi: 10.3390/ijms23158133.
    2. J. Marzi u. a., „Noninvasive Physical Plasma as Innovative and Tissue-Preserving Therapy for Women Positive for Cervical Intraepithelial Neoplasia“, Cancers, Bd. 14, Nr. 8, Art. Nr. 8, 2022, doi: 10.3390/cancers14081933.
    3. L. Becker u. a., „Data-Driven Identification of Biomarkers for In Situ Monitoring of Drug Treatment in Bladder Cancer Organoids“, International Journal of Molecular Sciences, Bd. 23, Nr. 13, Art. Nr. 13, 2022, doi: 10.3390/ijms23136956.
    4. F. Fischer, A. Birk, P. Somers, K. Frenner, C. Tarín, und A. Herkommer, „FeaSel-Net: A Recursive Feature Selection Callback in Neural Networks“, Machine Learning and Knowledge Extraction, Bd. 4, Nr. 4, Art. Nr. 4, 2022, doi: 10.3390/make4040049.
    5. N. Harland u. a., „Elevated Expression of the Immune Checkpoint Ligand CD276 (B7-H3) in Urothelial Carcinoma Cell Lines Correlates Negatively with the Cell Proliferation“, International Journal of Molecular Sciences, Bd. 23, Nr. 9, Art. Nr. 9, 2022, doi: 10.3390/ijms23094969.
    6. P. Somers u. a., „Growth of Simulated Tumors Under the Influence of Oxygen Supply“, IFAC-PapersOnLine, Bd. 55, Nr. 20, Art. Nr. 20, 2022, doi: 10.1016/j.ifacol.2022.09.170.
    7. C. Veil u. a., „Electro-Mechanical Coupling in Impedance-Based Tissue Differentiation Under Compression\ast“, IFAC-PapersOnLine, Bd. 55, Nr. 20, Art. Nr. 20, 2022, doi: 10.1016/j.ifacol.2022.09.155.
    8. R. Geng u. a., „CD24: A Marker for an Extended Expansion Potential of Urothelial Cancer Cell Organoids In Vitro?“, International Journal of Molecular Sciences, Bd. 23, Nr. 10, Art. Nr. 10, 2022, doi: 10.3390/ijms23105453.
    9. Y. Wei u. a., „Urinary Tract Tumor Organoids Reveal Eminent Differences in Drug Sensitivities When Compared to 2-Dimensional Culture Systems“, International Journal of Molecular Sciences, Bd. 23, Nr. 11, Art. Nr. 11, 2022, doi: 10.3390/ijms23116305.
    10. S. Walz, V. Aslani, O. Sawodny, und A. Stenzl, „Robotic radical cystectomy – more precision needed?“, Current Opinion in Urology, Bd. Publish Ahead of Print, Dez. 2022, doi: 10.1097/mou.0000000000001072.

  3. 2021

    1. L. Becker u. a., „Raman Imaging and Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy for Diagnosis of Cancer State and Metabolic Monitoring“, Cancers, Bd. 13, Nr. 22, Art. Nr. 22, 2021, doi: 10.3390/cancers13225682.
    2. C. Veil, S. Petillon, J. Hotz, A. Knöller, A. Zimmermann, und O. Sawodny, „Minimally Invasive Sensors for Transurethral Impedance Spectroscopy“, IEEE Sensors Journal, Bd. 21, Nr. 20, Art. Nr. 20, Okt. 2021, doi: 10.1109/JSEN.2021.3108779.
    3. N. Harland und A. Stenzl, „Micro-Ultrasound: a way to bring imaging for prostate cancer back to urology“, Prostate International, Bd. 9, Nr. 2, Art. Nr. 2, Juni 2021, doi: 10.1016/j.prnil.2020.12.002.
    4. N. Harland u. a., „Organoide zur Weiterentwicklung der intraoperativen Diagnostik“, Der Urologe, Bd. 60, Nr. 9, Art. Nr. 9, Sep. 2021, doi: 10.1007/s00120-021-01595-5.
    5. M. Holl u. a., „Laparoscopic Peritoneal Wash Cytology-Derived Primary Human Mesothelial Cells for In Vitro Cell Culture and Simulation of Human Peritoneum“, Biomedicines, Bd. 9, Nr. 2, Art. Nr. 2, 2021, doi: 10.3390/biomedicines9020176.

Konferenzbeiträge

  1. 2023

    1. P. Somers, S. Urich, R. Sauer, J. Schüle, O. Sawodny, und C. Tarín, „Real-Time Software-in-the-Loop Simulation of the OpenAPS System“, in 2023 IEEE/SICE International Symposium on System Integration (SII), in 2023 IEEE/SICE International Symposium on System Integration (SII). Jan. 2023, S. 1–5. doi: 10.1109/SII55687.2023.10039344.

  2. 2022

    1. C. Veil, O. Makni, P. Somers, J. Schüle, C. Tarín, und O. Sawodny, „Detection Limits of Tetrapolar Impedance Sensors for Tissue Differentiation“, in 2022 44th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), in 2022 44th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC). Juli 2022, S. 1–4. doi: 10.1109/EMBC48229.2022.9871065.
    2. P. Somers, J. Schüle, C. Veil, O. Sawodny, und C. Tarín, „Geometric Mapping Evaluation for Real-Time Local Sensor Simulation“, in 2022 44th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), in 2022 44th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC). Juli 2022, S. 609–612. doi: 10.1109/EMBC48229.2022.9871932.
    3. J. Schüle, J. Haag, P. Somers, C. Veil, C. Tarín, und O. Sawodny, „A Model-based Simultaneous Localization and Mapping Approach for Deformable Bodies“, in 2022 IEEE/ASME International Conference on Advanced Intelligent Mechatronics (AIM), in 2022 IEEE/ASME International Conference on Advanced Intelligent Mechatronics (AIM). Juli 2022, S. 607–612. doi: 10.1109/AIM52237.2022.9863308.
    4. F. Fischer, K. Frenner, und A. M. Herkommer, „Sparse Mid-Infrared Spectra Enable Real-time and In-vivo Applications in Tissue Discrimination“, EPJ Web of Conferences, Bd. 266, S. 02004, 2022, doi: 10.1051/epjconf/202226602004.

  3. 2021

    1. C. Veil, R. Bach, P. Somers, O. Sawodny, und C. Tarín, „Geometry Factor Determination for Tetrapolar Impedance Sensor Probes“, in 2021 43rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), in 2021 43rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC). Nov. 2021, S. 6800–6805. doi: 10.1109/EMBC46164.2021.9629757.
    2. P. Somers, J. Schüle, C. Tarín, und O. Sawodny, „2D to 3D Segmentation: Inclusion of Prior Information using Random Walk Kalman Filters“, in 2021 43rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), in 2021 43rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC). Nov. 2021, S. 4222–4225. doi: 10.1109/EMBC46164.2021.9629734.
    3. J. Schüle u. a., „Multi-Physical Tissue Modeling of a Human Urinary Bladder“, in 2021 43rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), in 2021 43rd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC). Nov. 2021, S. 4297–4302. doi: 10.1109/EMBC46164.2021.9629482.

Studentische Abschlussarbeiten

  1. 2023

    1. M. Yu, F. Fischer, und S. Reichelt, „Masterarbeit: Simulation von Gewebespektren durch gewichtete Kombination latenter Räume in Autoencodern“, 2023.
    2. I. Mahninger, F. Fischer, und A. Herkommer, „Forschungsarbeit: Simulationsbasierte Optimierung von Einzelpunktmessungen bei der ATR-Spektroskopie“, 2023.

  2. 2022

    1. J. Zahn, S. Holdenried-Krafft, P. Somers, H. Lensch, und A. Schilling, „Master’s Thesis: Monocular Depth Estimation from Cystoscopy Videos using Unsupervised Adversarial Domain Adaptation“, 2022.
    2. V. Rilling, P. Kalwa, T. Schäffer, und O. Sawodny, „Bachelor’s Thesis: Influence of probe geometry and pressure ratio on water flow elastography (WaFE) measurements“, 2022.

  3. 2021

    1. A. Steinitz, V. Aslani, und A. Herkommer, „Masterarbeit: Untersuchung einer Digitalholografie-Methodik zur Gewebedifferenzierung“, 2021.
    2. J. Seibold, P. Somers, J. Schüle, C. Tarín, und O. Sawodny, „Bachelorarbeit: Modellierung des Wachstums von Krebszellen für die Erzeugung synthetischer Blasentumore“, 2021.
    3. S. Schöne, C. Veil, O. Sawodny, und C. Tarín, „Bachelorarbeit: Kompensation von Störeffekten bei minimalinvasiven Impedanzsensoren“, 2021.
    4. Z. Qi, F. Fischer, und A. Herkommer, „Research Work: Generation of spectral datasets for disease detection using deep learning“, 2021.
    5. O. Makni, C. Veil, O. Sawodny, und C. Tarín, „Master’s Thesis: Finite Element Analysis of Impedance Sensors for Tissue Differentiation“, 2021.
    6. S. Kunkel, C. Veil, J. Schüle, O. Sawodny, und C. Tarín, „Bachelorarbeit: Elektrische Gewebemodellierung im Rahmen der Gewebedifferenzierung mittels elektrischer Impedanzspektroskopie“, 2021.
    7. F. Krauß, J. Schüle, O. Sawodny, und C. Tarín, „Bachelorarbeit: Multimodale Gewebemodellierung für die modellgestützte Gewebedifferenzierung mittels elektrischer und mechanischer Eigenschaften“, 2021.
    8. M. Helbig, P. Kalwa, T. Schäffer, und O. Sawodny, „Bachelorarbeit: Entwicklung eines Elektrolytsensors zur Bestimmung des Elastizitätsmoduls in vivo“, 2021.
    9. R. Bach, C. Veil, P. Somers, O. Sawodny, und C. Tarín, „Master’s Thesis: Modelling and Computer-Aided Simulation of the Electrical Behaviour of Urinary Bladder Tissue“, 2021.
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